水俣市では、省資源やリサイクル、ごみ減量等に取り組み、環境負荷を少なくしているお店を「水俣市エコショップ」に認定しています。
エコショップに認定されたお店には、認定証及びステッカーを交付するほか、取組内容について市ホームページや広報等をとおして、市民に向けて情報発信を行います。なお、水俣市エコショップとしての活動状況を把握するため、年に1回の審査を行います。
ごみ減量女性連絡会議が審査（実態調査）し、市長が認定します。認定された店には認定証及びステッカーを交付します。認定証の有効期間は3年間で、この間年1回の定期審査が行われます。